南部晴政深知与上杉家拼国力根本就不会有好下场，再这样与上杉军僵持下去也不是个办法。于是，他就在九户政实、久慈政则、七户家国、栉引清长、姉带兼实等看似忠心耿耿，实则一身反骨的一门亲族众、外样众纷纷向南部家举起反旗后，就决定退守本据三户城，重新集结军势，并打算以此来尽可能拉长上杉军的补给线，于二户郡、三户郡等地占据地利之便进行层层阻击，迫使上杉军知难而退，从而让南部家获得一线生机。
然而，目前对于南部军来说最大的问题就是如何才能安全的将数千军势从僵持的状态下解脱。因为，两军相持，谁的阵脚先松动，谁就极有可能会被另一方击败。
按照兵法常理来说，主动撤退的一方天然处于劣势。部队在撤退的途中为了提高行军速度会将一些辎重物资抛弃。若是将领在撤退之时组织不力，各部的行军次序被打乱，挤成一团，那么谁都逃不掉。届时，殿军会被追兵击溃，前队的将士也会因此而受到惊吓而自发逃散。全军一乱，就很难再重新收拢，更不要提结阵抗敌了，十有八九会被追兵打得全军覆灭。
但也正因如此，古今中外许多名将会故意派出一支兵力假装败退，把急于扩大战果的敌军一步一步引入事先设下的伏击圈之中。所以，要不要对正在撤退的敌军穷追勐打，不仅仅是一道选择题，更是一道送命题。例如上杉家在发起加贺征伐时，上杉谦信的从兄长尾景连就是在率军孤军深入追击加贺一向一揆众遭到敌军反击而阵亡的。
不过，南部晴政这次是真的撤退。可南部军毕竟有数千之众，一旦后撤，动静必然不小，根本无法神不知鬼不觉的进行后撤。
而且，南部军这次还无法事先预设伏兵阻击上杉军。因为一方井城周边的城池兵砦大都陷落，若是贸然派兵设伏，极有可能会反被上杉军包了饺子。
南部晴政随后就开始着手安排各部后撤的次序，并详细规划好每一支军势的撤退路线，尽可能做到交替掩护后撤。
不仅如此，南部晴政还下令在一方井城、七时雨山、高仓山等险要之地多设旗帜来虚张声势，以此来让上杉军认为南部军本队仍然驻扎在一方井城。
为了掩盖主动后撤的意图，南部晴政还派遣家中重臣泉山康朝（南部家四天王之一）、蓬田则政、目时筑前守等将率本部军势频繁袭扰上杉军，装出一副南部军即将要大举反攻的样子来。
然后，南部晴政则是在深夜之中，借着夜色掩护，率本队撤离了岩手郡一方井城。
这是撤退之中最为危险的时刻。除了留守在一方井城、七时雨山、高仓山等地的军势，南部军各部都处在偃旗息鼓的状态之中，在短时间内很难保持联络畅通。一旦遭遇突发情况，南部军各部很难迅速展开作战阵型，而原先所设立的防线也因缺乏守军而漏洞百出。若是有敌军来袭，就能从各部之间的结合部缝隙之中穿插，将南部军各部分割成好几段，让其首尾难以兼顾。当各部军势全部离开，并重新结阵而行，那反而是较为安全的行为。
尽管南部晴政严令各部封锁消息，禁止传播己方将要后撤的消息，打算在上杉军反应过来之前撤入三户郡。但最为不幸的是，上杉军在与南部军的相持之中，始终没有放松过对南部军的侦查。
正所谓若要人不知除非己莫为。南部晴政自以为撤退工作做得是天衣无缝，但是他忽略了上杉家的谍报能力非常强劲。
也就在南部晴政才做出后撤至三户郡的决定不久，加藤段藏就将这个消息告知了作为上杉军副将的八条景定。
景定以自己丰富的作战经验与麾下忍者们所探查到的情报相结合，并判断出南部军此次雷声大雨点小的攻势只不过是虚张声势，就怕他们会趁机向北后撤。他连忙召集诸将进行军议，分配好每一个人的进攻路线和作战要点。
就在上杉军上下都做好了出兵准备之际，八条景定还不忘命人将被俘的筑田诠泰、岩清水义教等残害高水寺斯波一族的原高水寺斯波家重臣斩首示众，以儆效尤。
当然，景定可不会真的听从足利义辉之命与南部家进行停战议和，在他眼里，足利义辉所颁下的御教书简直和废纸没有什么太大的区别。
为了让足利义辉不再介入奥羽两州的局势，景定反而派人向足利将军家控诉南部家、浪冈北畠家意图于陆奥一国复兴南朝，为祸一方，表示上杉家此举也是为了奥羽两州和关东八国的安稳以及拱卫当今朝廷和足利将军家的统治而不得已为之，希望足利将军家能够谅解此事。
随后，景定还让长尾彦丸（柿崎景家之子，长尾土左守之婿）带着自己的书信去回复上杉谦信，表示自己必然会与甘糟景持、长野业盛、加地春纲、千坂景亲等参阵的家中重臣竭尽全力辅左少主上杉氏虎静谧奥羽两州，尽快讨取恶逆之人南部晴政，还奥羽两州诸将一个公道。
同时，景定还重新整编了南部讨伐军。为了能一击制胜，他就以家中骁将石桥广繁担任先阵，河村秀时、江柄民部、栃内源蔵、河村喜助等原高水寺斯波家家臣为先导役，先于大军北上攻略一方井城；太田资正为前备，葛西义定、本庄实乃为左备，石川定光为后备，最上义守为右备，相马盛胤、田村隆显为游军，长野业盛、加地春纲、千坂景亲、真田幸隆、片仓景亲、八条景资、芦野资丰、真壁久干等部为本队直辖军势；甘糟景持仍为军奉行，高城胤吉担任小荷驮奉行，宇都宫定纲担任军粮奉行，太田资纲、富永政家二人负责留守在闭尹郡，梶原兼宗、山本左卫门尉等水军众诸将则是从宫古湾继续北上袭扰南部领沿海的八户城、新田城、根城、三泽城等地。
至于出羽方面，景定则是令安东爱季、户泽道盛、六乡晴泰、本堂朝亲等将负责攻略南部家治下的鹿角郡和陆奥津轻诸郡；尹达辉宗、大宝寺义增、小野寺辉道等羽前、南出羽诸将则是与上杉军本队一同北上攻略南部领的二户郡、三户郡等地。