阐截两教教义本就不同，元始天尊看重根脚与天资，而通天教主则是有教无类，故而截教弟子远比阐教弟子要多得多，大有万仙来朝之势，如今历经三代人皇，截教自然会发展得更为壮大，这便让阐教在人阐截三教变成了垫底的存在。
元始天尊极好脸面，如此境遇自然会让他觉得很不舒服，但当初是他看重三皇的功德，抢先选择了三皇的最后一位和五帝的第一位，如今想来，实在是有欠考虑，可是如今大局已定，元始天尊也根本没有机会再改变什么。
但要元始天尊看着阐教在人族建立的根基随着截教的壮大而慢慢凋零，他显然也做不到，于是他便让自己门下的弟子出山，在人族之中继续传播阐教教义，算是稳固阐教在人族的根基，并让门下十二金仙在洪荒之中各自选择洞府，传播阐教教义。
元始天尊如此做法，通天教主自然看在眼中，但元始天尊毕竟是他的兄长，而阐教也只是传教，并没有『插』手人皇之事，故而通天教主也是睁一眼闭一眼，并且告诫门下弟子，不能与阐教弟子发生矛盾，但可惜，事与愿违。
阐截两教同时在人族之中传道，自然免不了磕磕碰碰，毕竟他们谁都想在人族繁华的地带传道，而且阐教弟子秉承了元始天尊的傲气，甚至有些看不起截教弟子，这让截教弟子如何能够接受，自然矛盾越来越大，甚至还动了手，若非有所顾忌，恐怕都会出人命了。
事情发展到这般地步，通天教主自然也不会一味地迁就元始天尊和阐教，只是稍微约束了一番门下弟子，便不再理会，而截教弟子也在人族之中大肆发展截教，不断地蚕食阐教的根基，截教的有教无类与阐教的精英政策，显然截教的教义能够在人族之中发展得更好。
等到了大禹时期，阐教在人族之中的根基已然变得十分薄弱，相比之下，截教则是如日中天，即便是人教都无法与之相比，一时之间，截教一跃成为洪荒之中气运最盛的教派，万仙来朝之势更盛，在人族之中也算是根基深厚，即便三皇五帝结束，恐怕也没有哪一教能够撼动截教的地位。
大禹，三皇五帝之中的最后一位人皇，在舜在位的时期，人族境内突发天灾，大雨连绵不绝，此乃天定之灾，即便是圣人也不敢轻易地改变，这是天道对人族的一个考验，也是为了让大禹这最后一位人皇顺利地登上人族共主之位。
舜在求教其师父无当圣母无果的情况下，不得不在人族之中寻找大贤来治理泛滥的河水，最终选定了大禹的父亲鲧，而鲧在治水这一方面确实也有些才能，他采用围堤堵截的方式来治理水患，初期还是颇有成效的，但好景不长，人力岂能与天灾相抗。
原本建好的堤坝纷纷被洪水冲垮，人族之中的水患变得更加的眼中，舜得知之后，不由为之大怒，下令将鲧处死，而鲧死后，他的尸身内竟然诞生了一个婴儿，为截教大弟子多宝道人所救，并收为弟子，并给这个婴儿起名为禹。
大禹跟随多宝道人修行仙道，但却一直没有忘却人族水患之事，再想修仙的同时，他也在不断地想办法来治理人族水患，以为其父雪耻，在大禹成年之后，他终于想到了治水之法，父亲鲧采用的是围堤堵截的治水之法，治标不治本。
而大禹想出的方法乃是堵不如疏，既然围堤堵截无法根治水患，那不如开辟河道，将洪水引入大海之中，如此人族的水患自然就解决了，为此，他特意寻了一副临近大海而又患有水患的地带，开山凿石，开辟河道，将洪水引入了大海之中。
随着大禹的成功，附近的人族纷纷请求大禹帮助他们治理水患，大禹自然没有拒绝，一来二去，大禹的贤名也渐渐地在人族之中传播开来，最后更是传到了人族共主舜的耳朵里，舜在得知大禹是鲧的儿子之后，心中也颇为纠结。
但舜毕竟心系整个人族，岂会为了一己私心而放任水患为祸人族，于是舜便亲自去相请大禹前来治水，大禹也没有推辞，在舜的帮助之下，他开始治理整个人族之中的水患，这可是一个巨大的工程，与此同时所面临的的困难也是今非昔比的。
为了帮助大禹治水，多宝道人特意为他炼制两件后天法宝，一为开山斧，可以帮助大禹开山劈石，二为定海神针，可助大禹测量水深水浅，镇压肆虐的水患，当然，开山凿石，开辟河道，这还并不是最大的难事，真正的困难乃是妖族。
妖族多生活在深山水域之中，如今人族如此动作，自然让他们大受影响，好在截教之中诸多弟子都是妖族出身，交流起来也方便，能动口解决的自然不会动手，更何况还有地仙道在，帮助人族解决水患，这可是一个获取大功德的机会，地仙道的妖族又岂会错过。
有了地仙道的帮助，大禹治水自然变得更加顺利，足足花费了近百年的时间，才终于平定了人族的水患，这也让大禹在人族之中拥有了足以比拟人族共主的贤名，然而大禹在证道之后，却并没有将人族共主之位传给大禹，而是传给了自己的儿子商均。
商均成为人族共主之后，大禹为了避嫌，便躲到了阳城，然而商均在人族之中并无声望，人族之中那些部落的首领自然不服商均，于是便纷纷弃商均而前往阳城朝见大禹，在如此情况之下，商均只能无奈的退位让贤，将人族共主之位让给了大禹。
大禹上位之后，分封商均于虞，改定历法为夏历，与此同时也在人族之中大兴改革之风，渐渐形成了以夏族为中心的格局，这也是王权最初的形态，并且大禹重新划分天下，改为冀、兖、青、徐、扬、荆、豫、梁、雍九州，自此，三皇五帝真正进入了尾声。