随着越后上杉家从越中守护代神保家手中夺取新川郡、妇负郡后，上杉清定所担任的越中守护才算正式实任了。
为了避免越中守护代神保家再度崛起，以及越中、加贺一向一揆众势力的扩大，清定不得不开始考虑安排家臣来镇守越中。
天文九年，九月三十日。
因为有在越后开展检地的经验，山本寺定长、桃井义孝、直江景纲等人就在秋收尚未结束之际，完成了对妇负郡、新川郡两郡的检地。
清定也因此一方面掌握了新川郡、妇负郡两郡的实际产出，一方面还了解到这两郡与原先各地领主、肝煎指出检地的产量有着较大的出入。
之前新川郡、妇负郡两郡的各地领主、肝煎自行申报指出检地为十九万一千石，但是在经过大规模检地后却是二十六万石，石高差异达到了六万九千石。
随后，清定不仅对原先臣从降服的国人领主下发了本领安堵状，甚至还对瑞泉寺、胜兴寺、善德寺、天平寺、总海寺等越中一向宗寺院的寺领进行安堵。
其中，妇负郡只有五家外样领主：小岛城城主小岛职镇（所领一万石）、城生城城主斋藤利忠（所领一万五千石）、白鸟城城代神保觉广（所领五千石）、吴羽山城城主水越盛重（所领两千石）、长泽城城主安藤职张（所领五千石）。
而新川郡有六家外样领主：松仓城城主椎名常长（所领两万石）、堀江城城主土肥政忠（所领四万八千石）、佛生寺城城主细川兵部大辅入道（所领八千石）、大村城城主辔田雅正（所领一万石）、小出城城主唐人兵库正（所领五千石）、鱼津城城代铃木国重（所领两千石）。
减去外样领主的领地后，越后上杉家在此次越中攻略中新夺了十三万石的领土。
对于这些国人领主来说，只要能主动臣从降服，其当知行权和地位不仅不会因为越后上杉家而遭到否定，反而能得到承认甚至增强。所以，他们都愿意前来出仕越后上杉家，并递交誓书和人质。
当然，越后上杉家对一向宗寺院的寺领安堵只是走个过程罢了，因为先前的金吾畠山家、越中守护代神保家都对越中一向宗寺院持放任的态度。虽说越中守护代神保家在神保庆宗担任家督之时一度联合了匠作畠山家、越后上杉家（府中长尾家），向越中一向宗展开攻击，但之后又畏惧长尾能景、长尾为景父子二人，就转而倒向了越中一向宗一方。
原须川城城主金子尚纲，从越后鱼沼郡转封至越中新川郡若栗城，领有六千石知行地；
原千手城城主下平吉长，从越后鱼沼郡转封至越中妇负郡田中城，领有一万石知行地，并担任妇负郡郡代；
至于国人领主，大多因不谙统治，时时刻刻都有被下克上的危险，其存在的基础并不是特别稳定。他们见越后上杉家介入越中一国后其实还是感到非常高兴的。
这也就导致越中一向宗在加贺一向宗的支持下，于砺波郡、南射水郡两地根深蒂固。
原六万骑城城主福岛政为，从越后鱼沼郡转封至越中新川郡宫崎城，领有一万五千石知行地；
原高柳城城主斋木尚重，从越后刈羽郡转封至越中新川郡津毛城，领有一万两千石知行地；
原饭塚灰毛城城主甘糟泰重，从越后三岛郡转封至越中新川郡鱼津城，领有一万五千石知行地；
“欠所处分”意味着否定该土地从前领主的权利，所有权暂归清定（胜利的大名）。与之相对，对愿意归顺的领主，则可承认其领有，即完全保障其既有的领地权利，表面上看，似乎清定没有统治权，实际上并非如此。表示归顺的人，必须出仕并行臣服之礼，此外还需接受允许领有的手续。若非如此，他的土地将被视作无主之地，成为没收的对象。
原犬伏城城主丸山昌明，从越后颈城郡转封至越中妇负郡富崎城，领有一万五千石知行地，并担任妇负郡郡司；
原松山城城主富永长纲，从越后颈城郡转封至越中妇负郡八尾山城，领有四千石知行地；
清定鉴于越后上杉家在越中一国的根基不深，统治还不算稳固，就对臣从降服的国人领主、原越中守护代神保家旧臣大都进行本领安堵，只有对越后上杉军造成一定伤亡，以及阻碍越后上杉军进入越中之人，才会进行欠所处分（没收其领地）。
原柿崎城城主柿崎景家，从越后颈城郡转封至越中新川郡富山城，领有三万石知行地，赐予朱柄伞（免许之一），并担任新川郡郡司；
而此时的越后上杉家仅有一个半领国（越后一国，越中半国）。
原安田城城主安田景元，从越后刈羽郡转封至越中新川郡池田城，领有两万石知行地，并担任新川郡郡代；
······
从表面上看清定不战便将这些越中国人领主收入到自己的势力范围之下，但对于这些土地和武士，他不能像在自己领国那样拥有绝对的统治权，也不能过多干涉这些领主统治的权力，最多不过将一部分地区或矿山、海港等变成自己的直辖地。
很快，清定就着手进行了新夺领地的分配：
与一向一揆众交恶相比，清定情愿在稳定了妇负郡、新川郡两郡后，将目光投向东面。既然已经将越中守护代神保家重创，并夺取了越中两郡，那么在分配完新夺领地之后就得要支援陷入苦战的伊达晴宗了。
不过，清定深知在一向宗寺领检地以及实行追捕权的后果。因为，在另一个次元里，松平家康就尝试过这样做，最后引发范围波及三河全境的三河一向一揆，甚至连不少谱代家臣都背叛了冈崎松平家。
原鱼津城城代铃木国重，从越中东新川郡转封至西新川郡太田本乡城，领有三千石知行地；
这样，经过承认领有和没收，领主的统治权就遍及领内所有土地，只有被大名承认领有或得到大名分封的人才能确立其领主的地位。以这种方式统治的令制国，被称作（大名）领国或分国。