秦王没有想到金逸尘在军队改革上能如此快的顺利完成，只能点头让金逸尘进行接下来最难的改革。
返回荣城后，金逸尘开始对秦国现行的行政制度进行了改革。
各地均已设立人才中正委员会并完成委员任命选举，学堂和学院的初步建设也已完成。
在不久的将来金逸尘将会面临一个巨大的问题，人多而职位少，大兴教育却没能有足够的职位给他们发光发热。
这要求金逸尘除了之后的对外扩张，对内必须尽快调整现行的行政体系，改革官制，增加各级官员的数量，把中央到地方的职能进行更加具体的细分。
同时通过对行政制度的改革，收回地方的权力，加强中央集权，提高行政效率，为之后的对外扩张做准备。
于是，在地方上采用郡县制，将二十二座城池撤城立县，划分成三个郡，分别是：天水郡、武安郡、沙洲郡。
天水郡下辖7城2关隘，武安郡下辖7城2关隘，沙洲郡下辖8城1关隘。
天水郡行政中心为咸都，武安郡行政中心为荣县（城改县），沙洲郡行政中心为祁县。
原来各城的大夫全部变为县令，增设县丞、县尉、主吏掾、仓吏、狱吏等基础官职。
县以下，一些大的人口聚居区设乡一级，任命乡长、乡丞、乡三老、亭长、里正等乡级基础官职。
县以上设郡，任命郡守、郡丞、郡尉、郡监、主簿、长史等官职。
中央设三省六部即尚书省、门下省、中书省，吏部、礼部、工部、刑部、兵部、户部。
为了改革的顺利进行，荀彧任尚书令，陈群任吏部侍郎暂代吏部尚书一职。
例如：原丞相华茗升任中书令，由其组建中书省。王城邬升任兵部侍郎暂代兵部尚书一职，组建兵部。以此类推根据原先的职务，咸都中央官员全部更换职称，然后就出现了很多位置空缺没有合适的人选这一情况。
金逸尘趁机在秦国内宣布一年后进行第一届咸都学院选官考核，届时秦国青年才俊根据考核成绩走马上任，正式确立了秦国未来的官员选拔制度。
秦国二十二城均已成立人才中正委员会，设立了各自的官学（少年学堂和青年学院）。也正在进行第一届秦国人才评议工作，将各城的青年才俊评级。同时将评级改为一年两次，春季一次，秋季一次。
地方上的学院学员，前三品的才俊前往咸都学院学习，中三品的才俊留在地方学院学习，后三品的继续学习等待新一次评级。
当然进入了咸都学院并不意味着可以高枕无忧，咸都学院采用末位淘汰制。前七品的学员可继续在学院内学习，后两品的学员退回到地方学院学习。
在第一届咸都学院考核后，每三年进行一次考核。
此外，将原求贤阁改为翰林院，经过选官考核后，所有选上的才俊入翰林院任翰林学士，等待吏部的任命。
对于外国前来秦国的人才，特设立翰林院对外人才考核处。首先会对这些外国人才展开九品评级，随后他们必须进入咸都学院学习。
秉持一视同仁的原则，这些外国人才唯有参加选官考核并且通过才能够获得在秦国为官的资格，进入翰林院。
金逸尘对官员们的俸禄也进行的调整，更改如下：
一品官，月奉300两白银加120石粟米。二品官，月奉200两白银加80石粟米。
三品官，月奉100两白银加80石粟米。四品官，月奉60两白银加40石粟米。
五品官，月奉40两白银加20石粟米。六品官，月奉20两白银加15石粟米。
七品官，月奉10两白银加10石粟米。八品官，月奉5两白银加10石粟米。
九品官，月奉2两白银加10石粟米。
以上是各品级官职的基本俸禄，同时为了激励官员勤勉政务，提升行政效能，增设绩效考核和基本补助。
绩效考核就是对各品级官员的工作每半年进行评定，最后根据评定结果发放一至三个月不等的基本俸禄，若考核不通过则罚薪一至三个月。
基本补助则是考虑到官员在日常政务处理中的各项开销而设立。从一品到九品官员，每月皆可获得一定数量的炭火、灯油补助，以满足其办公与生活所需。
在冬季，还会额外发放棉衣、棉被等保暖物资，确保官员能够安心履职。
此外，对于官员的家眷，根据品级高低，也会给予相应的生活补贴予以照顾，使官员们无后顾之忧，全身心投入到工作之中。
毕竟，只有给予相对优厚的俸禄，才能够在一定程度上降低贪污腐败滋生的可能性，然而，想要彻底根绝腐败却是绝无可能的事情。
故而，建立一套完备且行之有效的监督制度以对其进行纠偏就显得尤为必要。
金逸尘精心谋划，推行三轨制监督体系，此体系包含两明一暗三条监督脉络。其中，明面上的监督机构为新建的都察院以及经过改革的皇城司，暗处的监督力量则是锦衣卫。
都察院直属门下省，可依法依规对各级官员展开调查与弹劾行动，有力地维护朝廷的清正廉洁与纲常秩序。
皇城司则主理咸都的治安事务，同时肩负监察锦衣卫的重任。
锦衣卫则直接受命于秦王（现今暂归金逸尘统辖），其职责在于收集那些被弹劾官员的实证，并且对各地官员实施暗中监察，一旦有所发现，便即刻将相关材料递送至都察院。
此三轨制设立的初衷，便是为了促使这三个机构彼此之间能够形成有效的监督与制约机制。例如，当都察院对锦衣卫的某人发起弹劾时，则由皇城司介入调查。皇城司或其他官员被都察院弹劾则由锦衣卫调查。
通过这种相互制衡的方式，确保权力在制度的框架内运行，避免一方势力独大，以维护整个国家行政体系的公正与清明。
因为金逸尘之前的雷厉风行，血腥残暴加上手握重兵，地方上的官员根本不敢提意见，有意见的人也被赵云或者陆炳请喝茶了，咸都内秦王全力支持中央也很快就完成了改革。
至此，秦国自上而下完成了新生，国力开始飞快上涨。