在敲定好对沙俄的策略后，各国君主都纷纷回国了，朱由渠也开始召集自己的一众将领商议准备撤军的事情。
如今奥斯曼的皇宫朱由渠已经还给了默罕默德四世，自己搬到了城外的军营中。将领们来到大帐向朱由渠行完礼，岳鹏飞随口问道：“陛下准备撤军了？”“嗯，朕确有此意。我二十万大军长年在外也不是个办法，所以，我们要尽快撤军，否则如今的奥斯曼是无法供给我军开销的。”将领们都点头认可皇帝的说法，李岩边点头边接话道：“陛下，我们的大军确实可以撤走，但这边我们也不能完全不管了。臣建议还是应该留下一些军队才行。”朱由渠思索了片刻：“要不这样吧，留下一个师在这边，其余的都撤回去。这个师也不能待在一个地方，两个旅驻在高加索地区，帮助各国联军围剿沙俄。剩下的两个旅则分为三部，一个团前往塞浦路斯，一个团前往直布罗陀，一个团前往普利茅斯港。等与沙俄的战争结束后，这两个旅就前往塞浦路斯驻扎，保证丝路局的安全。以后我们还要在塞浦路斯建立军港，以控制地中海的海权。再往后，我大明还要在海外建立各种军事基地，朕要让欧洲各国随时在我大明的军事威胁之下。”听完朱由渠的宏伟蓝图，一众将领都齐声道：“陛下圣明。”朱由渠此时已是志得意满，随后继续对将领们笑道：“这不算什么，虽然欧洲的事情解决的，但回去的路上朕还要解决一个国家，那就是莫卧儿。不知先生有何看法？”李岩迟疑片刻道：“陛下，臣以为，那个地方比较封闭，我们管理起来很难，因此我大明没必要统治莫卧儿，只需控制或者肢解它就可以了。”朱由渠认可的点了点头。确实这些阿三太埋汰了，大明的士兵去了会受不了的，到时候让他们割让几个重要港口，将莫卧儿锁在内陆，强行让他们错过这个海洋时代就可以了。如此，大明便可以将莫卧儿当成原料产地和商品倾销地，简直一举多得。想到这里朱由渠的嘴角露出了一丝邪魅的笑。两日后，除了第一军的一个师留下外，其余的二十万大军全部撤离了伊斯坦布尔，向着布哈拉而去。看着留下的将士们，朱由渠心中有些难受。这些将士已经离开家六年多了，现在他们还要继续留守在这里。不过这也是没有办法的事，但是他们也不会在这里留守太久了，等自己回去了，就让第四军团的人轮流来换防。
就在朱由渠班师回朝之前，远在大明腹地的两大外戚已经开始了他们的战争。第八军和第十二军并没有像孙焕之所预料的那样，在江西打起来，而是东进到南直隶，在安庆到芜湖一带相遇，并发生了激烈的战斗。由于秦拱民轻敌冒进，第十二军第一师被张君明两个师围困在池州，损失惨重，但未能全歼。待十二军第三师赶到后，张君明便撤除了包围。但由于秦拱民咬的比较紧，张君明撤退时发生失误，变成了溃败。导致第八军第一师两个旅在青阳附近被包围，经过三天的激战，这两个旅几乎被全歼。这让张君明也损失惨重，于是他产生了一个大胆的想法，为什么要跟秦家人在这里耗着了，如果东进夺取南京，然后将燕王殿下推上皇位，等陛下回来让他当太上皇不行吗？于是说干就干，他便带着大军往东而去。而秦拱民鉴于上一次的教训，不敢再轻敌冒进，因此并没有跟随张君明快速东进，而是稳步向前推进。
随着第八军的逼近，守卫在南京城里的公孙术不得不加强防守，同时赶紧调江西的两个师回援。然而远水解不了近渴，大军回援还要很长的时间。现在已经是火器时代，城墙根本没用，为了不伤及城中百姓，所以公孙术只能出城迎战了。可他一个师根本不是张君明一个军的对手，经过两天的激战，公孙术付出了一个旅的伤亡后被张君明击溃，残部逃往了滁州。随后张君明便占领了南京。然后在张君泽和张氏家族的怂恿下，燕王朱慈炬在南京称帝，年号宣武。这让刚刚进入南直隶的第十二军有些手足无措，秦拱民便撤回了武昌，秦家人经过商议，在武昌城立汉中王朱慈熠为帝，年号宣统。秦家人便以第十二军为基础，征召了两万人马，然后便发起了东征。双方在南直隶展开了激战，虽然这些兵不对老百姓烧杀抢掠，但整个长江沿岸却被打成了废墟，同时双方也付出了重大的人员伤亡。第八军的老兵减员过半，第十二军的原有班底也没多少了。南直隶很多百姓失去了家园，到处流离失所。三个五年计划才搭建起来的南直隶工业体系，七成以上被破坏，大明的财政收入减少近五分之一。这可把孙焕之给心疼坏了，但陛下又一直联系不上，于是他拼命的向欧洲派遣信使，希望能联系上朱由渠，不然整个南直隶就完了。
由于张君明前往了南京，因此海上的信使得以顺利到达波斯湾。可信使到达摩苏尔时才得知，陛下已经离开奥斯曼了，现在已经往布哈拉去了，于是信使又马不停蹄的向布哈拉赶去。最后在哈什哈巴德（今土库曼斯坦的首都）追上了朱由渠的大军。信使将国内的情况报给朱由渠后，他瞬间眼前一黑，晕了过去。，直到夜里他才醒过来。醒来后，见秦昀姝一个人陪在他身边，他随即对秦昀姝道：“快，快让李岩和将军们来见朕。”秦昀姝点了点头，然后起身去传话了。李岩和一众将领都知道这事的严重性，所以都在外面等着。片刻后，大家便走了进来，不待众人行礼，朱由渠直接坐了起来：“诸位，情况大家应该都知道了，说说吧，如何应对？”岳鹏飞第一个出列道：“陛下勿悠，末将这就带兵往回赶，为陛下平叛。”李岩赶紧制止道：“不可，岳将军从这里回去，何时能赶到。因此，臣建议，派出信使，传令李定国南下平叛。第六军团依旧按原计划进行，向南协助第五军团攻略莫卧儿，第一军团跟随陛下继续东归。”“好，就按先生说的办，不过朕要提前走。”“陛下不可。”李岩接着劝道：“如果您急于东归，势必让中亚和欧洲各国有所怀疑。如果让他们知道大明有内乱，那么刚刚树立起来的威信便不复存在了。所以臣建议，陛下依旧按照原计划跟随大军东归，同时去视察沿路被征服的地区。有李定国在，大明出不了乱子。”听完李岩的分析，朱由渠陷入了沉思。良久后，朱由渠才开口道：“好吧，就按先生说的办。不过，去给李定国传令的信使，不能再单枪匹马的去了。你们想，这已经是第五批信使了，而且还是从海上来的。孙阁老不可能只派海上的信使，应该还有陆路的，可我们一个信使都没有见到。那么前面的信使了？走西域的信使了？应该都遭遇了不测，但西域又是我们的后方，那么到底出了什么问题了？所以派出一个营的人马护送信使前往北京。”“喏！”