林琛的奏章与应对之策，如同投入平静湖面的石子，在江南与京城同时激起了不同性质的涟漪。
杭州这边，戚继光的“东南卫所武备讲习所”在刻意保持低调的情况下，悄然运转。第一批被“请”来的卫所军官们，从最初的抵触、好奇，到被燧发枪的齐射轰鸣、简易测绘带来的战场视野提升所震撼，心态发生了微妙的变化。当戚继光并非空谈战法，而是结合三江口、赭山战例，用炭笔在木板上画出敌我态势、火力覆盖范围，分析为何选择某处登陆、为何能迅速突破时，这些习惯于凭经验、勇力和模糊指令打仗的老行伍，第一次直观地感受到了“谋定后动”、“数据支撑”的力量。
更重要的是，林琛授意格物院派去的年轻士子，在操练间隙，并非高高在上地宣讲道理，而是拿着改良后的鲁班尺、水平仪，现场演示如何快速测量壕沟深度、城墙坡度、火炮仰角，甚至用简易的沙盘推演攻防。这些实实在在能用、能减少伤亡、能提高效率的“小技巧”，比任何大道理都更能打动这些中下层军官。尽管他们未必理解背后的数理原理，但“好用”、“有用”四字，已足以让他们收起部分轻视，甚至开始私下打听，能否让自己的子弟也去格物院“沾点墨水”。
胡宗宪在亲眼看过一次讲习所的火器操演和战术讲解后，沉默良久，对陪同的张经叹道：“元质（张经字），以往我等总笑书生纸上谈兵。如今观之，林部堂这不是纸上谈兵，这是……这是把兵书刻在了火铳上，画在了地图里啊。此子所图，恐怕不止于平倭。”他敏锐地察觉到，林琛在做的，是在重塑东南的军事思维，乃至……权力结构。
张经默然点头，他虽仍有武人的傲气，却不得不承认，这套东西确有其独到之处。至少，若他麾下卫所兵能有这般训练和器械，何至于被倭寇打得如此狼狈？对于林琛通过戚继光暗示的，希望他“推荐”更多军官轮训，并逐步在关键卫所试点更换部分老旧火器、推广新式操典的建议，他保持了默许，甚至开始暗自盘算哪些心腹可先送进去。
高捷的“查账”进行得并不顺利。胡宗宪得了林琛嘱咐，将各项开支账目做得滴水不漏，尤其是战时的临时征调、赏功抚恤，皆有名目、有签押、有存根，符合朝廷旧例。至于新军日常额外耗费、格物院研发，则完全从巡抚衙门公账中剥离，账目由王启年的人单独掌管，高捷根本无从插手。他试图从市舶司、盐课等税收中寻找“挪用”痕迹，也被早有准备的相关官员用“战后重建急需”、“历年积欠”等理由挡回。几番下来，非但没抓到把柄，反而因过于纠缠细务，惹得一些原本中立的官员心生厌烦，觉得这位御史大人有些小题大做，不识大体。
倒是刘炳然案，在高捷的“关切”下，按察司不得不加快了审理进度。一批与刘炳然直接勾结、证据确凿的中下层官吏、商贾被迅速定罪量刑，该杀的杀，该流放的流放，杭州官场为之一肃。百姓拍手称快，林琛“林青天”之名更加响亮。但高捷很快发现，案卷中所有可能指向更高层、更复杂网络的线索，都语焉不详或干脆缺失，仿佛刘炳然只是一个孤立的贪官污吏。他心知肚明是林琛做了手脚，却苦无证据，反而因为催促进度，被林琛顺势将“彻查通敌案、肃清奸佞”的功劳，又分走了一块。
京城方面，林琛那份详细报捷并附有《训操纲要》的奏章，以及胡宗宪、张经、俞大猷、卢镗乃至戚继光等人的联名请功疏，几乎是同时送达通政司，旋即被送入西苑精舍。
据说嘉靖皇帝在丹房静修时览毕，难得地离开了蒲团，走到悬挂的东南海疆图前，凝视良久，对侍奉在侧的司礼监掌印太监黄锦道：“林琛这小子，倒真把事儿办成了。斩首一千七，自损不过半百，水陆并进，焚巢捣穴……便是当年威继光（注：此处为皇帝口误或泛指名将）平倭，也不过如此吧？”
黄锦何等机敏，连忙躬身笑答：“皇爷圣明，慧眼识人。林琛此捷，确是我朝多年来少有之大胜，足显皇爷天威浩荡，用人得宜。只是……”他略微迟疑。
“只是什么？”嘉靖目光依旧在地图上。
“只是外廷有些议论，说林琛所用之法过于奇诡，耗费亦是不菲，更有人忧心其借平倭之名，擅权东南……”黄锦小心翼翼地说着，观察着皇帝的脸色。
嘉靖不置可否地“嗯”了一声，手指无意识地敲击着地图上杭州的位置：“耗费几何，户部、兵部不是正在核查么？至于擅权……他一个工部尚书，奉旨平倭，仗打完了，是该回来了。浙直总督的人选，内阁议得如何了？”
黄锦心中了然，皇帝对林琛的功劳是认可的，但对其久驻东南、手握精兵也并非全无顾虑。平衡与制衡，永远是帝王心术的核心。“回皇爷，内阁这几日为此争论不休。严阁老举荐了南京兵部尚书王学夔，说其老成持重，熟悉南直隶事务；徐阁老则以为，东南新定，百废待兴，需得力干员镇抚，或可在当地巡抚、布政使中择贤擢升，如浙江巡抚胡宗宪，此番协理军务，亦颇有功……”
“胡宗宪？”嘉靖挑了挑眉，不置可否，“再议吧。北边蓟辽的急递到了吗？王忬怎么说？”
话题被引向了北疆，黄锦知道，关于东南人事的讨论暂时告一段落，但皇帝心中那杆秤，已经开始倾斜。
就在朝堂为东南善后、人事安排争论不休时，林琛派出的“特殊使者”，历经曲折，终于与那群滞留宁波外海岛屿的葡萄牙人搭上了线。
使者化名“陈海”，扮作泉州某大海商（实为与王启年有隐秘联系的走私头子）的得力管事，借口采购“西洋奇巧器物”和“寻觅通晓泰西营造、火器之法的巧匠”，通过几重复杂的中间人，在一个风急浪高的夜晚，登上了葡萄牙人那艘半搁浅在礁石间的卡拉维尔帆船。
船上的情况比预想的更糟。这艘船原本属于一支小型的葡萄牙远东探险商队，因遭遇风暴与海盗袭击，与主力失散，船体受损，迷失航向，最终困在此处。船上共有二十余人，包括船长、导航员、炮手、木匠以及几名试图前往日本传教未果的耶稣会士。他们缺衣少食，武器弹药也所剩无几，与当地私枭交易，也只是为了换取最基本的补给，同时焦急地寻找返回澳门或马六甲的机会。
“陈海”的出现，以及他所代表的“江南豪商”愿意出重金聘请技师、购买知识的意向，无疑是一根救命稻草。然而，这些葡萄牙人也非易于之辈，船长迪奥戈·费尔南德斯虽然处境艰难，却异常警惕，反复盘问“陈海”的背景、目的，尤其是对火器技术和造船知识的兴趣，超出了普通商人的范畴。
谈判在一种相互试探、充满不信任的氛围中进行。“陈海”按照林琛的指示，抛出了诱人的条件：高额佣金，安全护送至指定地点（暗示可以是明朝控制下的某个港口），并承诺为其修复船只提供必要材料。作为交换，对方需要提供若干名精通数学、天文、几何、火器制造或船舶设计的“学者”或“技师”，为期一至两年，以“顾问”身份工作，并需交出他们携带的部分航海图、星图、数学及工程类书籍（或抄本）。
费尔南德斯船长最初断然拒绝，认为这是变相的扣押和知识掠夺。但“陈海”不急不躁，一方面展示“财力”（带来的部分金银），另一方面暗示，若无他们的帮助，这艘船和所有人迟早会被明朝水师或更可怕的海盗发现，后果难料。同时，他也保证，“顾问”的人身安全和工作自由会得到尊重，期满后去留自愿。
僵持了数日，船上日益恶化的处境和几名渴望摆脱困境、对神秘东方充满好奇的耶稣会士的劝说，最终让费尔南德斯船长松口。但他坚持只派出两人：一名叫安东尼奥·卡布拉尔的年轻耶稣会士，他精通数学、几何，略通天文；以及一名叫佩德罗·门德斯的经验丰富的造船木匠兼初级炮手。书籍方面，只肯交出几本非核心的航海日志副本和一本旧的、有破损的《几何原本》拉丁文抄本。并要求“陈海”方面先行提供修复船只的关键材料和部分补给。
“陈海”请示林琛后，同意了这有限的交换条件。他明白，这已是目前能做到的最好结果。重要的是建立联系，获得最初的“火种”。
当王启年将这份密报呈给林琛时，林琛长久地注视着那两个拗口的异国名字和那本《几何原本》。他知道，这意味着什么。这微弱的、来自遥远西方的知识星火，即将以最隐秘的方式，汇入他试图在古老东方点燃的变革之火中。虽然最初只能得到两人和一本旧书，但这突破性的接触本身，其象征意义和未来可能带来的连锁反应，无法估量。
“安排最可靠的路线和地点，秘密接应这两人。身份要绝对保密，对外就说是从澳门聘请的‘番匠’和‘通译’。格物院那边，李振他们做好准备，要以师礼相待，但学习的同时，也要注意甄别和转化。”林琛慎重吩咐，“至于那艘船，按约定给予必要帮助后，让他们自行离去。不要留下任何把柄。”
“是！”
几乎就在东南这边秘密接引西洋“星火”的同时，京城通往杭州的官道上，八百里加急的驿马，正承载着一道新的旨意，风驰电掣而来。这道旨意，将直接决定林琛是留是走，是功成名就回京受赏，还是继续在东南的惊涛骇浪中搏击。
林琛站在修订完毕、即将发出的《训操纲要》最终稿前，目光沉静。他已经做了能做的一切准备：军事上的胜利与渗透，政治上的奏对与联署，经济上的账目清晰，甚至冒险开启了对外知识的引入。现在，他需要等待紫禁城中的那双眼睛，如何落下这枚关键的棋子。